Dans les écosystèmes aquatiques, le comportement des populations bactériennes est régi par des facteurs biotiques, principalement par les microalgues. L'objectif de ce travail consiste à déterminer l'action, non encore élucidée, d'une picocyanobactérie Chroococcale : Synechocystis sp. sur le comportement de certaines bactéries d'intérêt sanitaire (Escherichia coli, Salmonella sp. et Vibrio cholerae non-O1). Cette algue qui domine dans les eaux usées du lagunage de Marrakech en période chaude, a été isolée et cultivée au laboratoire sous des conditions contrôlées de lumière et de température. Les substances extracellulaires et intracellulaires de la culture algale ont été testées vis-à-vis des bactéries étudiées. Les substances extracellulaires libérées au cours de la phase stationnaire de croissance de Synechocystis sp. et qui ont été récoltées dans le surnageant de la culture algale, réduisent la croissance d'E. coli et de Salmonella sp. et stimulent celle de V. cholerae non-O1. Aussi, les substances intracellulaires, obtenues après l'éclatement des cellules algales par l'éther, exercent un effet réducteur de la croissance d'E. coli et de Salmonella sp.. Les produits élaborés par Synechocystis sp. en culture non axénique (en présence de bactéries hétérotrophes) réduisent beaucoup plus la croissance d'E. coli et de Salmonella sp. en comparaison avec ceux libérés par la même microalgue mais en culture axénique. La dominance de cette picocyanobactérie, surtout en période chaude, dans les eaux usées du second bassin de lagunage de Marrakech, pourrait contribuer à l'explication de la dynamique et de la survie des bactéries étudiées (E. coli, Salmonella sp. et V. cholerae non-O1) au sein de cet écosystème aquatique fonctionnant sous climat méditerranéen aride.