Las enfermedades infecciosas fueron señaladas como la causa principal de muerte en las sociedades pasadas. Sin embargo, hasta el momento son escasos los conocimientos acerca del modo en que afectaron a las poblaciones humanas del sur de Sudamérica. El objetivo de este trabajo es estudiar el impacto que las enfermedades infecciosas tuvieron sobre las poblaciones de cazadores-recolectores que habitaron Patagonia Austral, a partir de la identificación, descripción e interpretación de lesiones óseas en restos humanos del Holoceno medio y tardío (aproximadamente 5200-100 años aP). Se analizaron macroscópicamente 54 individuos hallados en 50 sitios arqueológicos, sobre los cuales se describieron presencia, localización, lateralidad, tipo de formación de hueso nuevo (woven, lamelar, mixto) y distribución de las lesiones óseas. Se registraron lesiones diagnósticas y altamente compatibles con infecciones óseas en ocho (14,8%) individuos (sin diferencias entre sexos y edades), seis de los cuales (75,0%) provienen del sur de Tierra del Fuego. Cuatro individuos presentaron lesiones compatibles con osteomielitis y dos con tuberculosis (un no-adulto y un adulto). Esto último representa un hallazgo relevante para discutir la presencia de tuberculosis en poblaciones pasadas y su evolución en América. Los resultados presentados sugieren además que las evidencias de procesos infecciosos pueden ser recurrentes en análisis específicos sobre muestras esqueletales de cazadores-recolectores.