Le fonctionnement des barrages situés sur la partie amont du Lot et de son affluent la Truyère influence la qualité des eaux des parties moyenne et inférieure, ou Lot canalisé. Cette influence est analysée à l'aide d'un modèle mathématique des écoulements qui permet de préciser les origines des diverses masses d'eau circulant sur 235 km du Lot canalisé. Des profils amont-aval réalisés à différentes époques de l'année ont dégagé les principaux facteurs de variation des teneurs en matières minérales et organiques, dissoutes ou particulées, en suspension dans l'eau. Dans un ordre d'importance décroissante, ces facteurs sont la saison, la turbidité et la minéralisation de l'eau.

L'influence saisonnière est surtout due à la température de l'eau, principal facteur explicatif des variations de chlorophylle a dans un modèle de régression multiple. Elle est accentuée par la diminution des débits d'étiage lors de l'exploitation hydro-électrique de la rivière en été.

La turbidité est surtout liée à la présence de matières minérales. Les effets les plus importants et les plus durables vers l'aval sont dus aux crues du Dourdou, affluent drainant des terrains gréseux du permo-trias. Les apports par ruissellement en période de pluie ont un effet moindre ; ceux directement liés aux activités humaines - gravières et rejets divers - parfois importants, demeurent localisés. Pour des débits encore modérés, les lâchers des barrages provoquent la remise en suspension des sédiments non stabilisés. Les algues augmentent la turbidité principalement sous la forme de matière organique inerte mêlée à des matières minérales.

Les eaux provenant de la Truyère, moins minéralisées, se révèlent moins propices aux développements d'algues que celles du Lot amont. Cependant, la corrélation positive existant entre la conductivité et la température traduit l'importance des rejets urbains et industriels au cours de l'étiage d'été.

Un échantillonnage du peuplement ichtyologique (octobre 1972) et trois séries de prélèvements d'invertébrés (janvier, mars et mai 1973) effectués dans le cours supérieur d'un ruisseau forestier, ont fait l'objet d'une analyse des relations trophiques à partir de l'étude du régime alimentaire de la plupart des 57 espèces répertoriées.

Les différentes variations observées (modifications du régime alimentaire en fonction de l'âge, de la taille, de l'époque et des habitats), ainsi que le schéma général de l'édifice biologique, soulignent la complexité des relations trophiques à l'intérieur de ce peuplement proche, des sources et de composition relativement simple.

Les Naididae (27 espèces) et les Tubificidae (21 espèces) prédominent parmi les 64 espèces récoltées de 1974 à 1976. Limnodrilus hoffmeisteri est l'espèce à la fois la plus constante et la plus abondante (environ 25 % de l'effectif total). Les populations les plus diversifiées appartiennent au Haut Rhône et au cours inférieur du fleuve en aval de la confluence de l'Isère.

Les populations des secteurs amont et aval du Rhône, du lac Léman et du Danube présentent un degré élevé de similitude. La corrélation significative existant entre la constance et l'abondance relative des espèces recencées témoigne de l'importance de la pollution dans la répartition du potamobenthos.

Les voies de transfert du fer et du cuivre sont étudiées chez Lymnaea truncatula par histochimie, histopathologie et dosages quantitatifs sur les masses molles globales de ces animaux. Le fer pénètre par les régions péritentaculaires et le tube digestif ; il est excrété par les "cellules à cytoplasme dense" des acini de la glande digestive et par les ovocytes de la glande génitale. Les régions péritentaculaires sont seules responsables de la pénétration du cuivre ; ce dernier est véhiculé par les amibocytes et excrété au niveau des granules formés par les "cellules digestives" de la glande digestive.

Ce travail donne une liste de 33 espèces de Tipulidae s. s. récoltées à l'état imaginal dans l'environnement immédiat d'une quarantaine de cours d'eau du Sud-Ouest de la France.

Quatorze espèces de Simuliidae ont été capturées dans le Lot et ses affluents. Les biotopes, les préférences écologiques, la répartition altitudinale, la période de vol et les espèces associées sont précisées pour chaque espèce. L'étude quantitative de la distribution des larves a permis un essai de zonation. Le genre Prosimulium domine au dessus de 1 000 m, tandis que O. variegata a son maximum plus bas, jusqu'à 350 m. Wilhelmia equina et W. salopiensis se rencontrent de préférence dans l'hyporhithron. Dans la partie canalisée le nombre d'espèces est très réduit. Seule S. argyreatum est abondante dans le potamon.

Les truites du ruisseau de la Mousquère s'alimentent essentiellement à partir de la dérive ; il y a cependant un certain choix sur le fond, notamment en ce qui concerne les Trichoptères. La faune d'origine exogène joue un rôle important dans la nutrition, au moins en été.

Des pêches ont été effectuées en 2 secteurs. Le taux de croissance est supérieur dans le secteur où la densité est moindre. Pour chaque classe d'âge, le coefficient K est en rapport inverse avec la densité. Il en résulte que la biomasse et la production annuelle sont comparables dans les deux secteurs étudiés, et que la nourriture disponible paraît être le facteur limitant la population. Il y a un déséquilibre entre les individus jeunes et ceux de 3 ans et plus, trop nombreux.